放牧１９日目：GEOからSRAに再登録されたデータたち

書かねば忘れることを思い知ったので、書きます...orz

・次世代シーケンサでの解析結果は、
世に出てきた当初は専用のDBなどが整備されていなかったので，
GEOに混じって登録されていた．
・現在は，NCBIなら，SRA(Sequence Read Archive)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra
が整備され、以前GEOにとりあえず登録されていたものが，再登録しなおされている．
・再登録されたものはSRAのデータの方に，これはGEOのGSExxxのデータですよと何らかの記述がある．（はず）

今日までの作業で，GEOから，次世代シーケンサの結果（だと思われるもの）を抽出してみた．
方法は，
・GEOのデータを全てなぞり，PMIDや，GPL（PL->プラットフォーム）の情報を抜き出す．
・SRAのデータを全てなぞり，データにGEOのアクセッション番号の頭文字＋数字を抜き出す．
・上の二つのファイルをGEOの番号で合わせる．
（これで，得たテーブルのGPL情報は次世代シーケンサのものと考えられる）
・得たテーブルにあるGPLと同じ番号を持つGEOのデータを抽出

　..結果は追記します